Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
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SAMD8Q96LT4 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
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SAMD8Q96LT4 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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SAMD8Q96LT4 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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SAMD8Q96LT4 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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SAMD8Q96LT4 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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SAMD8Q96LT4 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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SAMD8Q96LT4 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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SAMD8Q96LT4 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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