Protein–RNA interactions for Protein: Q96JX3

SERAC1, Protein SERAC1, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERAC1Q96JX3 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERAC1Q96JX3 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERAC1Q96JX3 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERAC1Q96JX3 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERAC1Q96JX3 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERAC1Q96JX3 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERAC1Q96JX3 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERAC1Q96JX3 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERAC1Q96JX3 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERAC1Q96JX3 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERAC1Q96JX3 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERAC1Q96JX3 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERAC1Q96JX3 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERAC1Q96JX3 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERAC1Q96JX3 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERAC1Q96JX3 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERAC1Q96JX3 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERAC1Q96JX3 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERAC1Q96JX3 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERAC1Q96JX3 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERAC1Q96JX3 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERAC1Q96JX3 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERAC1Q96JX3 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERAC1Q96JX3 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERAC1Q96JX3 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERAC1Q96JX3 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERAC1Q96JX3 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERAC1Q96JX3 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERAC1Q96JX3 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERAC1Q96JX3 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERAC1Q96JX3 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERAC1Q96JX3 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SERAC1Q96JX3 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERAC1Q96JX3 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERAC1Q96JX3 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERAC1Q96JX3 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SERAC1Q96JX3 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SERAC1Q96JX3 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SERAC1Q96JX3 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERAC1Q96JX3 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERAC1Q96JX3 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERAC1Q96JX3 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERAC1Q96JX3 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERAC1Q96JX3 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERAC1Q96JX3 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SERAC1Q96JX3 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERAC1Q96JX3 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERAC1Q96JX3 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERAC1Q96JX3 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERAC1Q96JX3 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERAC1Q96JX3 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERAC1Q96JX3 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERAC1Q96JX3 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERAC1Q96JX3 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERAC1Q96JX3 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERAC1Q96JX3 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERAC1Q96JX3 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SERAC1Q96JX3 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SERAC1Q96JX3 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERAC1Q96JX3 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERAC1Q96JX3 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERAC1Q96JX3 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERAC1Q96JX3 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERAC1Q96JX3 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERAC1Q96JX3 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERAC1Q96JX3 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERAC1Q96JX3 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERAC1Q96JX3 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERAC1Q96JX3 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERAC1Q96JX3 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERAC1Q96JX3 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SERAC1Q96JX3 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERAC1Q96JX3 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERAC1Q96JX3 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERAC1Q96JX3 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SERAC1Q96JX3 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERAC1Q96JX3 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SERAC1Q96JX3 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERAC1Q96JX3 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERAC1Q96JX3 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERAC1Q96JX3 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERAC1Q96JX3 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERAC1Q96JX3 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERAC1Q96JX3 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERAC1Q96JX3 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERAC1Q96JX3 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERAC1Q96JX3 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERAC1Q96JX3 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERAC1Q96JX3 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERAC1Q96JX3 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERAC1Q96JX3 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERAC1Q96JX3 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERAC1Q96JX3 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERAC1Q96JX3 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERAC1Q96JX3 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERAC1Q96JX3 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERAC1Q96JX3 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERAC1Q96JX3 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SERAC1Q96JX3 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERAC1Q96JX3 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms