Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms