Protein–RNA interactions for Protein: Q93084

ATP2A3, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A3Q93084 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP2A3Q93084 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP2A3Q93084 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP2A3Q93084 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP2A3Q93084 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP2A3Q93084 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP2A3Q93084 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP2A3Q93084 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP2A3Q93084 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP2A3Q93084 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP2A3Q93084 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP2A3Q93084 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP2A3Q93084 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP2A3Q93084 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP2A3Q93084 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP2A3Q93084 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP2A3Q93084 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP2A3Q93084 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP2A3Q93084 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP2A3Q93084 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP2A3Q93084 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP2A3Q93084 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP2A3Q93084 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP2A3Q93084 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP2A3Q93084 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP2A3Q93084 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP2A3Q93084 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP2A3Q93084 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP2A3Q93084 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP2A3Q93084 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP2A3Q93084 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP2A3Q93084 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP2A3Q93084 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP2A3Q93084 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP2A3Q93084 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP2A3Q93084 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP2A3Q93084 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP2A3Q93084 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP2A3Q93084 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP2A3Q93084 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP2A3Q93084 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP2A3Q93084 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP2A3Q93084 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP2A3Q93084 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP2A3Q93084 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP2A3Q93084 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP2A3Q93084 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP2A3Q93084 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP2A3Q93084 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP2A3Q93084 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP2A3Q93084 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP2A3Q93084 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP2A3Q93084 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP2A3Q93084 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP2A3Q93084 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP2A3Q93084 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP2A3Q93084 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP2A3Q93084 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP2A3Q93084 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP2A3Q93084 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP2A3Q93084 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP2A3Q93084 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP2A3Q93084 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP2A3Q93084 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP2A3Q93084 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP2A3Q93084 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP2A3Q93084 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP2A3Q93084 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP2A3Q93084 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP2A3Q93084 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP2A3Q93084 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP2A3Q93084 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP2A3Q93084 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP2A3Q93084 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP2A3Q93084 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP2A3Q93084 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP2A3Q93084 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP2A3Q93084 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP2A3Q93084 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP2A3Q93084 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP2A3Q93084 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP2A3Q93084 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP2A3Q93084 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP2A3Q93084 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP2A3Q93084 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP2A3Q93084 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP2A3Q93084 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP2A3Q93084 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP2A3Q93084 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP2A3Q93084 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP2A3Q93084 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP2A3Q93084 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP2A3Q93084 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP2A3Q93084 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP2A3Q93084 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP2A3Q93084 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP2A3Q93084 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP2A3Q93084 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP2A3Q93084 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP2A3Q93084 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms