Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 COQ4-204ENST00000608951 781 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 AL135936.1-201ENST00000617956 998 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 COQ4-201ENST00000300452 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 F10-201ENST00000375551 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 AC007491.1-201ENST00000637560 1306 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 PCK2-208ENST00000559250 1804 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 CLCC1-202ENST00000348264 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 SNX15-201ENST00000352068 771 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 SIX3-AS1-201ENST00000419364 844 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 PSAT1P2-201ENST00000426107 972 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 AC111149.2-202ENST00000518355 599 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 DUT-207ENST00000559416 635 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 MED11-202ENST00000573708 802 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 FDFT1-214ENST00000528812 2013 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 DDX39B-AS1-208ENST00000420520 516 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 BX248123.1-201ENST00000429070 606 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 ASS1P2-201ENST00000439895 1223 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 CITED1-209ENST00000453707 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 AC113347.2-201ENST00000512350 279 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 AC019294.2-203ENST00000569596 594 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 AC023389.1-201ENST00000577846 576 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 Metazoa_SRP.75-201ENST00000614439 293 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 AC110057.1-201ENST00000636031 898 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 KLK4-201ENST00000324041 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 FCRL6-202ENST00000339348 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 S100A13-203ENST00000392623 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 COPS7B-204ENST00000409091 806 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 AC104961.1-201ENST00000427605 771 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 EXTL3-AS1-203ENST00000520023 780 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 AC087203.1-201ENST00000532111 1181 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 DLK1-205ENST00000556051 469 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 AC093503.1-201ENST00000593888 495 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 LINC01082-201ENST00000601250 441 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 PSMA6-215ENST00000622405 978 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms