Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms