Protein–RNA interactions for Protein: Q8N488

RYBP, RING1 and YY1-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYBPQ8N488 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RYBPQ8N488 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms