Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms