Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTX7

CATSPER4, Cation channel sperm-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPER4Q7RTX7 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CATSPER4Q7RTX7 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CATSPER4Q7RTX7 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CATSPER4Q7RTX7 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CATSPER4Q7RTX7 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CATSPER4Q7RTX7 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CATSPER4Q7RTX7 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CATSPER4Q7RTX7 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CATSPER4Q7RTX7 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CATSPER4Q7RTX7 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CATSPER4Q7RTX7 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CATSPER4Q7RTX7 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CATSPER4Q7RTX7 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CATSPER4Q7RTX7 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CATSPER4Q7RTX7 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CATSPER4Q7RTX7 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CATSPER4Q7RTX7 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CATSPER4Q7RTX7 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CATSPER4Q7RTX7 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CATSPER4Q7RTX7 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CATSPER4Q7RTX7 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CATSPER4Q7RTX7 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CATSPER4Q7RTX7 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CATSPER4Q7RTX7 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CATSPER4Q7RTX7 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CATSPER4Q7RTX7 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms