Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU7

SCX, Basic helix-loop-helix transcription factor scleraxis, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCXQ7RTU7 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC10□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC10□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC10□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC10□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC10□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC10□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC10□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC10□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC10□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC10□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 ITPR2-202ENST00000381340 11405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 DGKE-201ENST00000284061 8660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 C15orf39-202ENST00000394987 4430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 TRPA1-201ENST00000262209 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 ADGRG6-202ENST00000296932 6849 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC10□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 STRCP1-201ENST00000509801 5328 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms