Protein–RNA interactions for Protein: Q7L0J3

SV2A, Synaptic vesicle glycoprotein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2AQ7L0J3 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 Metazoa_SRP.96-201ENST00000621315 318 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms