Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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USP43Q70EL4 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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USP43Q70EL4 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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USP43Q70EL4 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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USP43Q70EL4 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
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USP43Q70EL4 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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USP43Q70EL4 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 TGM1-201ENST00000206765 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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