Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 VAMP7-202ENST00000286448 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 MAP2-201ENST00000199940 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 CEP131-201ENST00000269392 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 NDRG4-236ENST00000566192 3265 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 NUDT9-203ENST00000473942 2458 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 PCDHB19P-202ENST00000625133 2914 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 CSNK1G1-205ENST00000607537 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 COG1-201ENST00000299886 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 DCAF13-201ENST00000297579 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 LINC01428-201ENST00000449581 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 POTEB3-201ENST00000611217 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 PCDHA11-202ENST00000616325 3418 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 AGAP6-202ENST00000412531 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 TNFSF8-201ENST00000223795 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 GJB5-201ENST00000338513 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 AL772337.1-201ENST00000399186 2014 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 SLC25A18-202ENST00000399813 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 CCNE2-205ENST00000520509 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 RPS15A-213ENST00000576436 2190 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 DNMT3B-206ENST00000456297 2315 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 FAM214B-208ENST00000605244 3016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 DPAGT1-217ENST00000639704 1719 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 DCAF6-201ENST00000312263 3186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 ARAF-203ENST00000377045 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 CPLX4-202ENST00000587244 1916 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 DDX5-210ENST00000578804 2021 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LINC00299Q6ZSB3 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LINC00299Q6ZSB3 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LINC00299Q6ZSB3 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LINC00299Q6ZSB3 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LINC00299Q6ZSB3 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LINC00299Q6ZSB3 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LINC00299Q6ZSB3 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LINC00299Q6ZSB3 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LINC00299Q6ZSB3 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
LINC00299Q6ZSB3 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
LINC00299Q6ZSB3 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
LINC00299Q6ZSB3 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LINC00299Q6ZSB3 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LINC00299Q6ZSB3 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LINC00299Q6ZSB3 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LINC00299Q6ZSB3 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
LINC00299Q6ZSB3 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LINC00299Q6ZSB3 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LINC00299Q6ZSB3 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LINC00299Q6ZSB3 ELN-222ENST00000458204 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LINC00299Q6ZSB3 MAN2C1-242ENST00000569482 3177 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms