Protein–RNA interactions for Protein: Q5JTC6

AMER1, APC membrane recruitment protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMER1Q5JTC6 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
AMER1Q5JTC6 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
AMER1Q5JTC6 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
AMER1Q5JTC6 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AMER1Q5JTC6 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AMER1Q5JTC6 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AMER1Q5JTC6 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AMER1Q5JTC6 CDY3P-201ENST00000454543 1618 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
AMER1Q5JTC6 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AMER1Q5JTC6 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AMER1Q5JTC6 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AMER1Q5JTC6 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AMER1Q5JTC6 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AMER1Q5JTC6 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AMER1Q5JTC6 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AMER1Q5JTC6 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
AMER1Q5JTC6 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AMER1Q5JTC6 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AMER1Q5JTC6 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AMER1Q5JTC6 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AMER1Q5JTC6 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AMER1Q5JTC6 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AMER1Q5JTC6 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AMER1Q5JTC6 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AMER1Q5JTC6 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AMER1Q5JTC6 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AMER1Q5JTC6 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AMER1Q5JTC6 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AMER1Q5JTC6 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AMER1Q5JTC6 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AMER1Q5JTC6 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AMER1Q5JTC6 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AMER1Q5JTC6 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AMER1Q5JTC6 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
AMER1Q5JTC6 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AMER1Q5JTC6 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AMER1Q5JTC6 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AMER1Q5JTC6 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
AMER1Q5JTC6 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AMER1Q5JTC6 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AMER1Q5JTC6 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AMER1Q5JTC6 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AMER1Q5JTC6 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AMER1Q5JTC6 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AMER1Q5JTC6 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AMER1Q5JTC6 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AMER1Q5JTC6 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AMER1Q5JTC6 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AMER1Q5JTC6 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AMER1Q5JTC6 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AMER1Q5JTC6 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AMER1Q5JTC6 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AMER1Q5JTC6 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AMER1Q5JTC6 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AMER1Q5JTC6 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AMER1Q5JTC6 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
AMER1Q5JTC6 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AMER1Q5JTC6 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
AMER1Q5JTC6 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AMER1Q5JTC6 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
AMER1Q5JTC6 HTR4-207ENST00000520514 1236 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AMER1Q5JTC6 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
AMER1Q5JTC6 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AMER1Q5JTC6 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
AMER1Q5JTC6 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AMER1Q5JTC6 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AMER1Q5JTC6 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AMER1Q5JTC6 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AMER1Q5JTC6 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AMER1Q5JTC6 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AMER1Q5JTC6 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AMER1Q5JTC6 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AMER1Q5JTC6 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AMER1Q5JTC6 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AMER1Q5JTC6 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AMER1Q5JTC6 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AMER1Q5JTC6 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AMER1Q5JTC6 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AMER1Q5JTC6 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AMER1Q5JTC6 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AMER1Q5JTC6 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AMER1Q5JTC6 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AMER1Q5JTC6 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AMER1Q5JTC6 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AMER1Q5JTC6 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AMER1Q5JTC6 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AMER1Q5JTC6 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AMER1Q5JTC6 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AMER1Q5JTC6 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AMER1Q5JTC6 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AMER1Q5JTC6 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AMER1Q5JTC6 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AMER1Q5JTC6 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AMER1Q5JTC6 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AMER1Q5JTC6 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AMER1Q5JTC6 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AMER1Q5JTC6 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AMER1Q5JTC6 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AMER1Q5JTC6 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AMER1Q5JTC6 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms