Protein–RNA interactions for Protein: Q5H8C1

FREM1, FRAS1-related extracellular matrix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FREM1Q5H8C1 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FREM1Q5H8C1 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FREM1Q5H8C1 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FREM1Q5H8C1 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FREM1Q5H8C1 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FREM1Q5H8C1 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FREM1Q5H8C1 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FREM1Q5H8C1 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FREM1Q5H8C1 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FREM1Q5H8C1 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
FREM1Q5H8C1 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FREM1Q5H8C1 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FREM1Q5H8C1 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FREM1Q5H8C1 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FREM1Q5H8C1 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FREM1Q5H8C1 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
FREM1Q5H8C1 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
FREM1Q5H8C1 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
FREM1Q5H8C1 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FREM1Q5H8C1 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FREM1Q5H8C1 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FREM1Q5H8C1 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FREM1Q5H8C1 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FREM1Q5H8C1 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FREM1Q5H8C1 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FREM1Q5H8C1 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FREM1Q5H8C1 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FREM1Q5H8C1 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FREM1Q5H8C1 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FREM1Q5H8C1 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FREM1Q5H8C1 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FREM1Q5H8C1 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FREM1Q5H8C1 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FREM1Q5H8C1 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FREM1Q5H8C1 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FREM1Q5H8C1 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FREM1Q5H8C1 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FREM1Q5H8C1 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FREM1Q5H8C1 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FREM1Q5H8C1 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FREM1Q5H8C1 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FREM1Q5H8C1 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FREM1Q5H8C1 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FREM1Q5H8C1 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FREM1Q5H8C1 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
FREM1Q5H8C1 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FREM1Q5H8C1 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FREM1Q5H8C1 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
FREM1Q5H8C1 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FREM1Q5H8C1 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FREM1Q5H8C1 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FREM1Q5H8C1 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FREM1Q5H8C1 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FREM1Q5H8C1 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FREM1Q5H8C1 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FREM1Q5H8C1 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FREM1Q5H8C1 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FREM1Q5H8C1 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FREM1Q5H8C1 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FREM1Q5H8C1 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FREM1Q5H8C1 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FREM1Q5H8C1 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FREM1Q5H8C1 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FREM1Q5H8C1 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FREM1Q5H8C1 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FREM1Q5H8C1 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FREM1Q5H8C1 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
FREM1Q5H8C1 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FREM1Q5H8C1 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FREM1Q5H8C1 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
FREM1Q5H8C1 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FREM1Q5H8C1 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
FREM1Q5H8C1 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FREM1Q5H8C1 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FREM1Q5H8C1 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FREM1Q5H8C1 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FREM1Q5H8C1 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FREM1Q5H8C1 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FREM1Q5H8C1 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FREM1Q5H8C1 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FREM1Q5H8C1 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FREM1Q5H8C1 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FREM1Q5H8C1 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FREM1Q5H8C1 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FREM1Q5H8C1 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FREM1Q5H8C1 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FREM1Q5H8C1 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FREM1Q5H8C1 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FREM1Q5H8C1 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FREM1Q5H8C1 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FREM1Q5H8C1 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FREM1Q5H8C1 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FREM1Q5H8C1 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FREM1Q5H8C1 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FREM1Q5H8C1 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FREM1Q5H8C1 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FREM1Q5H8C1 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FREM1Q5H8C1 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FREM1Q5H8C1 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FREM1Q5H8C1 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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