Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms