Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 441.9 ms