Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms