Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TWISTNBQ3B726 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms