Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.6 ms