Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
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