Protein–RNA interactions for Protein: Q16836

HADH, Hydroxyacyl-coenzyme A dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHQ16836 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HADHQ16836 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HADHQ16836 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HADHQ16836 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HADHQ16836 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HADHQ16836 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HADHQ16836 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HADHQ16836 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HADHQ16836 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HADHQ16836 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
HADHQ16836 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HADHQ16836 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
HADHQ16836 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HADHQ16836 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HADHQ16836 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HADHQ16836 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HADHQ16836 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HADHQ16836 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HADHQ16836 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HADHQ16836 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HADHQ16836 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HADHQ16836 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HADHQ16836 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HADHQ16836 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HADHQ16836 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HADHQ16836 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HADHQ16836 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HADHQ16836 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HADHQ16836 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HADHQ16836 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HADHQ16836 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HADHQ16836 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HADHQ16836 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HADHQ16836 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HADHQ16836 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HADHQ16836 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HADHQ16836 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HADHQ16836 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HADHQ16836 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HADHQ16836 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HADHQ16836 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HADHQ16836 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HADHQ16836 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HADHQ16836 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HADHQ16836 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HADHQ16836 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HADHQ16836 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HADHQ16836 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HADHQ16836 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HADHQ16836 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HADHQ16836 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HADHQ16836 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HADHQ16836 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HADHQ16836 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HADHQ16836 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HADHQ16836 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HADHQ16836 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HADHQ16836 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HADHQ16836 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HADHQ16836 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HADHQ16836 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HADHQ16836 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HADHQ16836 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HADHQ16836 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HADHQ16836 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HADHQ16836 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HADHQ16836 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HADHQ16836 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HADHQ16836 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HADHQ16836 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
HADHQ16836 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.64■□□□□ 0.1
HADHQ16836 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HADHQ16836 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HADHQ16836 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HADHQ16836 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HADHQ16836 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HADHQ16836 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HADHQ16836 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HADHQ16836 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HADHQ16836 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HADHQ16836 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HADHQ16836 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HADHQ16836 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HADHQ16836 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HADHQ16836 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HADHQ16836 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HADHQ16836 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HADHQ16836 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HADHQ16836 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HADHQ16836 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HADHQ16836 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HADHQ16836 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HADHQ16836 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HADHQ16836 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HADHQ16836 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HADHQ16836 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HADHQ16836 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HADHQ16836 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HADHQ16836 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HADHQ16836 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms