Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
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RTN1Q16799 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
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RTN1Q16799 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
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