Protein–RNA interactions for Protein: Q16576

RBBP7, Histone-binding protein RBBP7, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP7Q16576 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms