Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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