Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
USF2Q15853 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
USF2Q15853 ITPRIP-201ENST00000278071 6807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
USF2Q15853 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
USF2Q15853 RBM19-201ENST00000261741 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
USF2Q15853 MKLN1-203ENST00000421797 2460 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
USF2Q15853 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
USF2Q15853 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
USF2Q15853 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
USF2Q15853 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
USF2Q15853 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
USF2Q15853 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
USF2Q15853 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
USF2Q15853 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
USF2Q15853 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
USF2Q15853 ARAP1-204ENST00000393609 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
USF2Q15853 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
USF2Q15853 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
USF2Q15853 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
USF2Q15853 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
USF2Q15853 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
USF2Q15853 INCENP-202ENST00000394818 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
USF2Q15853 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
USF2Q15853 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
USF2Q15853 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
USF2Q15853 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
USF2Q15853 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
USF2Q15853 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
USF2Q15853 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
USF2Q15853 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
USF2Q15853 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
USF2Q15853 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
USF2Q15853 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
USF2Q15853 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
USF2Q15853 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC12.22□□□□□ -0.45
USF2Q15853 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC12.22□□□□□ -0.45
USF2Q15853 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
USF2Q15853 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
USF2Q15853 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
USF2Q15853 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
USF2Q15853 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
USF2Q15853 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
USF2Q15853 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
USF2Q15853 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
USF2Q15853 MAGEL2-201ENST00000532292 4298 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
USF2Q15853 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
USF2Q15853 AC068075.1-201ENST00000519714 1832 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
USF2Q15853 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
USF2Q15853 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
USF2Q15853 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
USF2Q15853 C5AR1-201ENST00000355085 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
USF2Q15853 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
USF2Q15853 ZBTB7B-203ENST00000417934 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
USF2Q15853 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
USF2Q15853 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
USF2Q15853 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
USF2Q15853 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
USF2Q15853 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
USF2Q15853 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
USF2Q15853 CPEB4-208ENST00000520867 2607 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
USF2Q15853 ELN-211ENST00000414324 3139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
USF2Q15853 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
USF2Q15853 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
USF2Q15853 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
USF2Q15853 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
USF2Q15853 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
USF2Q15853 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
USF2Q15853 SLIT2-204ENST00000504154 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
USF2Q15853 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
USF2Q15853 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
USF2Q15853 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
USF2Q15853 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
USF2Q15853 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
USF2Q15853 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
USF2Q15853 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
USF2Q15853 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
USF2Q15853 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
USF2Q15853 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
USF2Q15853 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
USF2Q15853 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
USF2Q15853 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
USF2Q15853 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
USF2Q15853 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
USF2Q15853 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
USF2Q15853 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
USF2Q15853 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
USF2Q15853 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
USF2Q15853 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
USF2Q15853 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
USF2Q15853 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
USF2Q15853 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
USF2Q15853 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
USF2Q15853 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
USF2Q15853 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
USF2Q15853 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC12.21□□□□□ -0.45
USF2Q15853 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
USF2Q15853 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
USF2Q15853 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
USF2Q15853 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
USF2Q15853 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
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