Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNA2Q15822 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNA2Q15822 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNA2Q15822 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNA2Q15822 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNA2Q15822 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNA2Q15822 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNA2Q15822 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNA2Q15822 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNA2Q15822 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNA2Q15822 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNA2Q15822 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNA2Q15822 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNA2Q15822 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNA2Q15822 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNA2Q15822 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNA2Q15822 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNA2Q15822 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNA2Q15822 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNA2Q15822 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNA2Q15822 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNA2Q15822 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNA2Q15822 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNA2Q15822 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNA2Q15822 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNA2Q15822 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNA2Q15822 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNA2Q15822 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNA2Q15822 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNA2Q15822 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNA2Q15822 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNA2Q15822 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNA2Q15822 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNA2Q15822 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNA2Q15822 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNA2Q15822 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNA2Q15822 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNA2Q15822 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNA2Q15822 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNA2Q15822 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNA2Q15822 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNA2Q15822 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNA2Q15822 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNA2Q15822 SIX3-AS1-202ENST00000456467 557 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNA2Q15822 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNA2Q15822 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNA2Q15822 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNA2Q15822 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNA2Q15822 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNA2Q15822 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNA2Q15822 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNA2Q15822 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNA2Q15822 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNA2Q15822 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNA2Q15822 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNA2Q15822 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNA2Q15822 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNA2Q15822 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNA2Q15822 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNA2Q15822 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNA2Q15822 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNA2Q15822 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNA2Q15822 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNA2Q15822 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHRNA2Q15822 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CHRNA2Q15822 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHRNA2Q15822 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHRNA2Q15822 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHRNA2Q15822 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHRNA2Q15822 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHRNA2Q15822 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHRNA2Q15822 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHRNA2Q15822 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHRNA2Q15822 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHRNA2Q15822 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHRNA2Q15822 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHRNA2Q15822 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHRNA2Q15822 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CHRNA2Q15822 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHRNA2Q15822 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHRNA2Q15822 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHRNA2Q15822 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHRNA2Q15822 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHRNA2Q15822 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHRNA2Q15822 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHRNA2Q15822 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHRNA2Q15822 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHRNA2Q15822 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHRNA2Q15822 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHRNA2Q15822 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHRNA2Q15822 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHRNA2Q15822 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHRNA2Q15822 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHRNA2Q15822 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHRNA2Q15822 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHRNA2Q15822 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHRNA2Q15822 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHRNA2Q15822 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHRNA2Q15822 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHRNA2Q15822 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
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