Protein–RNA interactions for Protein: Q15672

TWIST1, Twist-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWIST1Q15672 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 MYNN-201ENST00000349841 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 TMEM26-202ENST00000399298 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 BRWD1-204ENST00000380800 7605 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 MIER2-201ENST00000264819 6884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 MYRF-202ENST00000278836 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 AL008727.1-201ENST00000564460 4728 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 BAHD1-203ENST00000561234 4698 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 IGFN1-201ENST00000295591 4439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 ADAMTSL1-205ENST00000380548 8030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 TLK1-202ENST00000360843 5726 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 KLHL7-202ENST00000339077 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 FAM157A-203ENST00000634862 6083 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms