Protein–RNA interactions for Protein: Q15650

TRIP4, Activating signal cointegrator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP4Q15650 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIP4Q15650 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIP4Q15650 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIP4Q15650 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIP4Q15650 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIP4Q15650 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIP4Q15650 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIP4Q15650 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIP4Q15650 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIP4Q15650 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIP4Q15650 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIP4Q15650 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIP4Q15650 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIP4Q15650 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIP4Q15650 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIP4Q15650 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIP4Q15650 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIP4Q15650 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIP4Q15650 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIP4Q15650 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIP4Q15650 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIP4Q15650 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIP4Q15650 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIP4Q15650 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIP4Q15650 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIP4Q15650 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIP4Q15650 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIP4Q15650 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIP4Q15650 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIP4Q15650 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIP4Q15650 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIP4Q15650 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIP4Q15650 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIP4Q15650 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIP4Q15650 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIP4Q15650 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIP4Q15650 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIP4Q15650 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIP4Q15650 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIP4Q15650 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIP4Q15650 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIP4Q15650 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIP4Q15650 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIP4Q15650 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIP4Q15650 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIP4Q15650 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIP4Q15650 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIP4Q15650 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIP4Q15650 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIP4Q15650 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIP4Q15650 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIP4Q15650 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIP4Q15650 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIP4Q15650 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIP4Q15650 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIP4Q15650 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIP4Q15650 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIP4Q15650 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIP4Q15650 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRIP4Q15650 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRIP4Q15650 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRIP4Q15650 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRIP4Q15650 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIP4Q15650 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIP4Q15650 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIP4Q15650 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIP4Q15650 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIP4Q15650 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIP4Q15650 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIP4Q15650 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIP4Q15650 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIP4Q15650 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIP4Q15650 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIP4Q15650 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIP4Q15650 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIP4Q15650 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIP4Q15650 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIP4Q15650 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIP4Q15650 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIP4Q15650 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIP4Q15650 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIP4Q15650 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIP4Q15650 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIP4Q15650 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIP4Q15650 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIP4Q15650 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIP4Q15650 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIP4Q15650 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIP4Q15650 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIP4Q15650 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIP4Q15650 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIP4Q15650 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIP4Q15650 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIP4Q15650 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIP4Q15650 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIP4Q15650 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIP4Q15650 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIP4Q15650 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIP4Q15650 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIP4Q15650 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.8 ms