Protein–RNA interactions for Protein: Q15642

TRIP10, Cdc42-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP10Q15642 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TRIP10Q15642 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TRIP10Q15642 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TRIP10Q15642 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TRIP10Q15642 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TRIP10Q15642 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TRIP10Q15642 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TRIP10Q15642 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TRIP10Q15642 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TRIP10Q15642 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TRIP10Q15642 ZYG11A-201ENST00000371528 4469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TRIP10Q15642 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TRIP10Q15642 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TRIP10Q15642 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TRIP10Q15642 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TRIP10Q15642 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TRIP10Q15642 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TRIP10Q15642 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TRIP10Q15642 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TRIP10Q15642 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TRIP10Q15642 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TRIP10Q15642 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TRIP10Q15642 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRIP10Q15642 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRIP10Q15642 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRIP10Q15642 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRIP10Q15642 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRIP10Q15642 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRIP10Q15642 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRIP10Q15642 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRIP10Q15642 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRIP10Q15642 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRIP10Q15642 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRIP10Q15642 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRIP10Q15642 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRIP10Q15642 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
TRIP10Q15642 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRIP10Q15642 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRIP10Q15642 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
TRIP10Q15642 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRIP10Q15642 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
TRIP10Q15642 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRIP10Q15642 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRIP10Q15642 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRIP10Q15642 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
TRIP10Q15642 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRIP10Q15642 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRIP10Q15642 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRIP10Q15642 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRIP10Q15642 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
TRIP10Q15642 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
TRIP10Q15642 NAPB-202ENST00000398425 3824 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRIP10Q15642 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRIP10Q15642 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRIP10Q15642 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRIP10Q15642 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRIP10Q15642 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRIP10Q15642 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRIP10Q15642 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRIP10Q15642 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRIP10Q15642 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRIP10Q15642 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRIP10Q15642 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRIP10Q15642 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRIP10Q15642 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRIP10Q15642 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRIP10Q15642 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRIP10Q15642 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRIP10Q15642 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRIP10Q15642 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRIP10Q15642 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRIP10Q15642 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRIP10Q15642 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRIP10Q15642 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRIP10Q15642 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRIP10Q15642 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRIP10Q15642 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRIP10Q15642 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRIP10Q15642 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRIP10Q15642 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRIP10Q15642 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRIP10Q15642 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRIP10Q15642 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRIP10Q15642 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRIP10Q15642 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
TRIP10Q15642 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRIP10Q15642 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRIP10Q15642 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRIP10Q15642 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
TRIP10Q15642 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRIP10Q15642 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRIP10Q15642 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRIP10Q15642 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRIP10Q15642 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRIP10Q15642 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRIP10Q15642 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRIP10Q15642 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRIP10Q15642 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRIP10Q15642 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRIP10Q15642 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms