Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SS18Q15532 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
SS18Q15532 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SS18Q15532 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SS18Q15532 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SS18Q15532 TPR-201ENST00000367478 9708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SS18Q15532 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
SS18Q15532 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
SS18Q15532 MRVI1-216ENST00000547195 6155 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
SS18Q15532 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
SS18Q15532 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SS18Q15532 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
SS18Q15532 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
SS18Q15532 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SS18Q15532 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
SS18Q15532 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SS18Q15532 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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SS18Q15532 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SS18Q15532 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
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SS18Q15532 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SS18Q15532 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
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SS18Q15532 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SS18Q15532 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
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SS18Q15532 SPOUT1-201ENST00000361256 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SS18Q15532 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SS18Q15532 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
SS18Q15532 EPRS-201ENST00000366923 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SS18Q15532 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
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SS18Q15532 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SS18Q15532 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SS18Q15532 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
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SS18Q15532 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SS18Q15532 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
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SS18Q15532 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
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SS18Q15532 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
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SS18Q15532 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC10.37□□□□□ -0.75
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SS18Q15532 RGS12-202ENST00000338806 3010 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SS18Q15532 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
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SS18Q15532 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
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SS18Q15532 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
SS18Q15532 USP20-201ENST00000315480 4458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SS18Q15532 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
SS18Q15532 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SS18Q15532 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SS18Q15532 CD38-201ENST00000226279 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SS18Q15532 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SS18Q15532 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
SS18Q15532 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SS18Q15532 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SS18Q15532 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
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SS18Q15532 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SS18Q15532 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SS18Q15532 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SS18Q15532 BRWD1-204ENST00000380800 7605 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SS18Q15532 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SS18Q15532 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SS18Q15532 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SS18Q15532 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SS18Q15532 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SS18Q15532 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
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