Protein–RNA interactions for Protein: Q15119

PDK2, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK2Q15119 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDK2Q15119 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDK2Q15119 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDK2Q15119 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDK2Q15119 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDK2Q15119 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDK2Q15119 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDK2Q15119 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PDK2Q15119 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDK2Q15119 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDK2Q15119 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDK2Q15119 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDK2Q15119 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PDK2Q15119 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDK2Q15119 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDK2Q15119 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDK2Q15119 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PDK2Q15119 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDK2Q15119 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PDK2Q15119 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDK2Q15119 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDK2Q15119 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDK2Q15119 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDK2Q15119 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDK2Q15119 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDK2Q15119 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDK2Q15119 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDK2Q15119 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDK2Q15119 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDK2Q15119 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDK2Q15119 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDK2Q15119 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDK2Q15119 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDK2Q15119 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDK2Q15119 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDK2Q15119 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDK2Q15119 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDK2Q15119 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PDK2Q15119 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDK2Q15119 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDK2Q15119 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDK2Q15119 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDK2Q15119 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDK2Q15119 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDK2Q15119 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDK2Q15119 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDK2Q15119 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDK2Q15119 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDK2Q15119 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDK2Q15119 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDK2Q15119 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDK2Q15119 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDK2Q15119 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDK2Q15119 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDK2Q15119 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDK2Q15119 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDK2Q15119 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDK2Q15119 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDK2Q15119 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDK2Q15119 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDK2Q15119 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDK2Q15119 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDK2Q15119 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDK2Q15119 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDK2Q15119 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDK2Q15119 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDK2Q15119 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDK2Q15119 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDK2Q15119 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDK2Q15119 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDK2Q15119 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDK2Q15119 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PDK2Q15119 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDK2Q15119 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDK2Q15119 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PDK2Q15119 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDK2Q15119 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDK2Q15119 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDK2Q15119 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDK2Q15119 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDK2Q15119 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDK2Q15119 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PDK2Q15119 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDK2Q15119 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDK2Q15119 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDK2Q15119 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDK2Q15119 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDK2Q15119 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDK2Q15119 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDK2Q15119 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDK2Q15119 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDK2Q15119 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDK2Q15119 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDK2Q15119 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDK2Q15119 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDK2Q15119 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDK2Q15119 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDK2Q15119 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDK2Q15119 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDK2Q15119 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms