Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
NCF4Q15080 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
NCF4Q15080 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
NCF4Q15080 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
NCF4Q15080 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
NCF4Q15080 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
NCF4Q15080 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
NCF4Q15080 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.1
NCF4Q15080 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
NCF4Q15080 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
NCF4Q15080 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
NCF4Q15080 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
NCF4Q15080 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
NCF4Q15080 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
NCF4Q15080 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
NCF4Q15080 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
NCF4Q15080 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
NCF4Q15080 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
NCF4Q15080 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
NCF4Q15080 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
NCF4Q15080 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
NCF4Q15080 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
NCF4Q15080 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
NCF4Q15080 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
NCF4Q15080 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
NCF4Q15080 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
NCF4Q15080 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
NCF4Q15080 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
NCF4Q15080 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
NCF4Q15080 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
NCF4Q15080 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
NCF4Q15080 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
NCF4Q15080 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
NCF4Q15080 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
NCF4Q15080 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
NCF4Q15080 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
NCF4Q15080 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
NCF4Q15080 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
NCF4Q15080 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
NCF4Q15080 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
NCF4Q15080 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
NCF4Q15080 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
NCF4Q15080 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
NCF4Q15080 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
NCF4Q15080 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
NCF4Q15080 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
NCF4Q15080 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
NCF4Q15080 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
NCF4Q15080 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
NCF4Q15080 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
NCF4Q15080 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
NCF4Q15080 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC14.45□□□□□ -0.1
NCF4Q15080 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
NCF4Q15080 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
NCF4Q15080 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
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