Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 741 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms