Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
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