Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
DDX39BQ13838 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
DDX39BQ13838 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
DDX39BQ13838 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
DDX39BQ13838 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
DDX39BQ13838 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
DDX39BQ13838 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
DDX39BQ13838 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
DDX39BQ13838 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
DDX39BQ13838 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
DDX39BQ13838 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
DDX39BQ13838 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
DDX39BQ13838 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
DDX39BQ13838 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
DDX39BQ13838 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
DDX39BQ13838 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
DDX39BQ13838 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
DDX39BQ13838 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
DDX39BQ13838 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
DDX39BQ13838 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
DDX39BQ13838 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
DDX39BQ13838 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
DDX39BQ13838 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
DDX39BQ13838 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
DDX39BQ13838 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
DDX39BQ13838 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
DDX39BQ13838 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
DDX39BQ13838 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
DDX39BQ13838 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
DDX39BQ13838 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
DDX39BQ13838 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
DDX39BQ13838 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
DDX39BQ13838 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DDX39BQ13838 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DDX39BQ13838 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
DDX39BQ13838 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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