Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
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