Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 ZNF286A-201ENST00000395893 654 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 PTOV1-AS2-203ENST00000601893 719 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 COL16A1-202ENST00000373668 3643 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 ZNF226-201ENST00000300823 817 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 CFAP36-203ENST00000403007 759 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 AC023906.1-201ENST00000486386 453 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 AC087620.1-201ENST00000520037 447 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 AC009779.3-204ENST00000549424 367 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SPTAN1Q13813 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SPTAN1Q13813 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SPTAN1Q13813 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
SPTAN1Q13813 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SPTAN1Q13813 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SPTAN1Q13813 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SPTAN1Q13813 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SPTAN1Q13813 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SPTAN1Q13813 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SPTAN1Q13813 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SPTAN1Q13813 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SPTAN1Q13813 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SPTAN1Q13813 ATP5J-202ENST00000400087 826 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SPTAN1Q13813 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
SPTAN1Q13813 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
SPTAN1Q13813 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
SPTAN1Q13813 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SPTAN1Q13813 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SPTAN1Q13813 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
SPTAN1Q13813 AC018846.1-201ENST00000568231 183 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
SPTAN1Q13813 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SPTAN1Q13813 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
SPTAN1Q13813 AL078590.3-205ENST00000606039 465 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SPTAN1Q13813 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SPTAN1Q13813 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SPTAN1Q13813 TMC8-201ENST00000318430 4411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SPTAN1Q13813 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SPTAN1Q13813 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SPTAN1Q13813 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SPTAN1Q13813 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SPTAN1Q13813 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SPTAN1Q13813 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SPTAN1Q13813 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTAN1Q13813 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTAN1Q13813 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTAN1Q13813 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTAN1Q13813 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTAN1Q13813 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTAN1Q13813 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTAN1Q13813 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTAN1Q13813 PHF5A-201ENST00000216252 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTAN1Q13813 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTAN1Q13813 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTAN1Q13813 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTAN1Q13813 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTAN1Q13813 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTAN1Q13813 MYL6-218ENST00000550697 901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTAN1Q13813 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 899.3 ms