Protein–RNA interactions for Protein: Q13569

TDG, G/T mismatch-specific thymine DNA glycosylase, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDGQ13569 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TDGQ13569 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TDGQ13569 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TDGQ13569 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TDGQ13569 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TDGQ13569 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TDGQ13569 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TDGQ13569 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TDGQ13569 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TDGQ13569 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TDGQ13569 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TDGQ13569 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TDGQ13569 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TDGQ13569 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TDGQ13569 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TDGQ13569 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TDGQ13569 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TDGQ13569 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TDGQ13569 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TDGQ13569 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TDGQ13569 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TDGQ13569 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TDGQ13569 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TDGQ13569 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TDGQ13569 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TDGQ13569 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TDGQ13569 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TDGQ13569 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TDGQ13569 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TDGQ13569 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TDGQ13569 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TDGQ13569 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
TDGQ13569 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TDGQ13569 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TDGQ13569 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TDGQ13569 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TDGQ13569 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TDGQ13569 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TDGQ13569 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TDGQ13569 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TDGQ13569 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TDGQ13569 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TDGQ13569 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TDGQ13569 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TDGQ13569 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TDGQ13569 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TDGQ13569 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TDGQ13569 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TDGQ13569 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TDGQ13569 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TDGQ13569 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TDGQ13569 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TDGQ13569 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
TDGQ13569 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
TDGQ13569 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
TDGQ13569 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TDGQ13569 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TDGQ13569 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TDGQ13569 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
TDGQ13569 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TDGQ13569 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TDGQ13569 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TDGQ13569 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TDGQ13569 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TDGQ13569 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TDGQ13569 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TDGQ13569 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TDGQ13569 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TDGQ13569 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
TDGQ13569 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TDGQ13569 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TDGQ13569 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TDGQ13569 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TDGQ13569 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TDGQ13569 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TDGQ13569 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TDGQ13569 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TDGQ13569 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TDGQ13569 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
TDGQ13569 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TDGQ13569 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TDGQ13569 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TDGQ13569 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TDGQ13569 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TDGQ13569 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TDGQ13569 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TDGQ13569 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TDGQ13569 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TDGQ13569 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TDGQ13569 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TDGQ13569 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TDGQ13569 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TDGQ13569 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TDGQ13569 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TDGQ13569 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TDGQ13569 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TDGQ13569 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TDGQ13569 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TDGQ13569 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TDGQ13569 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms