Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ATRQ13535 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
ATRQ13535 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
ATRQ13535 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
ATRQ13535 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
ATRQ13535 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
ATRQ13535 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
ATRQ13535 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
ATRQ13535 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
ATRQ13535 AL356000.1-201ENST00000441073 1238 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
ATRQ13535 AC147876.1-201ENST00000504408 322 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
ATRQ13535 AC015795.2-201ENST00000512720 575 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
ATRQ13535 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
ATRQ13535 Metazoa_SRP.157-201ENST00000622819 262 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
ATRQ13535 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
ATRQ13535 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
ATRQ13535 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ATRQ13535 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
ATRQ13535 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ATRQ13535 UBOX5-AS1-201ENST00000446537 1792 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
ATRQ13535 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
ATRQ13535 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
ATRQ13535 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ATRQ13535 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
ATRQ13535 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
ATRQ13535 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
ATRQ13535 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ATRQ13535 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
ATRQ13535 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
ATRQ13535 TMEM9B-202ENST00000525069 1433 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
ATRQ13535 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ATRQ13535 RPF1-201ENST00000370654 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ATRQ13535 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
ATRQ13535 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ATRQ13535 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ATRQ13535 AL512599.1-201ENST00000430724 685 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
ATRQ13535 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
ATRQ13535 AC128689.1-202ENST00000459861 827 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
ATRQ13535 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC11.51□□□□□ -0.57
ATRQ13535 AC022113.2-201ENST00000504935 704 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
ATRQ13535 RPL18-205ENST00000549273 1036 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
ATRQ13535 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
ATRQ13535 AC021321.1-201ENST00000607397 1113 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
ATRQ13535 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
ATRQ13535 ZDHHC6-201ENST00000369404 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ATRQ13535 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
ATRQ13535 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
ATRQ13535 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ATRQ13535 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ATRQ13535 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ATRQ13535 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ATRQ13535 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ATRQ13535 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ATRQ13535 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ATRQ13535 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ATRQ13535 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ATRQ13535 KCTD6-205ENST00000490264 1759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ATRQ13535 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ATRQ13535 C1orf87-202ENST00000450089 1307 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ATRQ13535 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ATRQ13535 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ATRQ13535 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ATRQ13535 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ATRQ13535 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ATRQ13535 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ATRQ13535 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ATRQ13535 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ATRQ13535 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ATRQ13535 AC106869.1-201ENST00000448713 577 ntTSL 4 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ATRQ13535 AC068057.1-201ENST00000453322 709 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ATRQ13535 IGKV1OR2-108-201ENST00000453673 353 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ATRQ13535 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ATRQ13535 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ATRQ13535 MIR4640-201ENST00000581824 90 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
ATRQ13535 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ATRQ13535 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ATRQ13535 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ATRQ13535 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ATRQ13535 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ATRQ13535 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ATRQ13535 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ATRQ13535 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ATRQ13535 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
ATRQ13535 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ATRQ13535 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ATRQ13535 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ATRQ13535 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ATRQ13535 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ATRQ13535 ABCA17P-202ENST00000469908 4188 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ATRQ13535 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ATRQ13535 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ATRQ13535 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ATRQ13535 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ATRQ13535 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ATRQ13535 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ATRQ13535 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ATRQ13535 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ATRQ13535 PCBD1-201ENST00000299299 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ATRQ13535 LCN6-201ENST00000341206 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ATRQ13535 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
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