Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 AC090114.2-201ENST00000608477 7054 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 DISC1-206ENST00000366637 6848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 WTIP-202ENST00000590071 13665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.5 ms