Protein–RNA interactions for Protein: Q13129

RLF, Zinc finger protein Rlf, humanhuman

Predictions only

Length 1,914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLFQ13129 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RLFQ13129 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RLFQ13129 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RLFQ13129 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RLFQ13129 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RLFQ13129 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RLFQ13129 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RLFQ13129 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RLFQ13129 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RLFQ13129 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RLFQ13129 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RLFQ13129 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RLFQ13129 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RLFQ13129 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RLFQ13129 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RLFQ13129 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RLFQ13129 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RLFQ13129 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RLFQ13129 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RLFQ13129 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RLFQ13129 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RLFQ13129 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RLFQ13129 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RLFQ13129 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RLFQ13129 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RLFQ13129 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RLFQ13129 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RLFQ13129 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RLFQ13129 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RLFQ13129 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RLFQ13129 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RLFQ13129 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RLFQ13129 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RLFQ13129 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RLFQ13129 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RLFQ13129 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RLFQ13129 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RLFQ13129 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RLFQ13129 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RLFQ13129 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RLFQ13129 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RLFQ13129 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RLFQ13129 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RLFQ13129 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RLFQ13129 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RLFQ13129 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RLFQ13129 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RLFQ13129 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RLFQ13129 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RLFQ13129 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RLFQ13129 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RLFQ13129 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RLFQ13129 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RLFQ13129 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RLFQ13129 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RLFQ13129 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RLFQ13129 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RLFQ13129 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RLFQ13129 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RLFQ13129 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RLFQ13129 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RLFQ13129 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RLFQ13129 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RLFQ13129 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RLFQ13129 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RLFQ13129 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RLFQ13129 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RLFQ13129 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RLFQ13129 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RLFQ13129 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RLFQ13129 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RLFQ13129 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RLFQ13129 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RLFQ13129 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RLFQ13129 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RLFQ13129 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RLFQ13129 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RLFQ13129 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RLFQ13129 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RLFQ13129 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RLFQ13129 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RLFQ13129 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RLFQ13129 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RLFQ13129 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RLFQ13129 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RLFQ13129 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RLFQ13129 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RLFQ13129 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RLFQ13129 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RLFQ13129 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RLFQ13129 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RLFQ13129 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RLFQ13129 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RLFQ13129 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RLFQ13129 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RLFQ13129 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RLFQ13129 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RLFQ13129 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RLFQ13129 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RLFQ13129 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
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