Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.1 ms