Protein–RNA interactions for Protein: Q12908

SLC10A2, Ileal sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A2Q12908 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC10A2Q12908 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms