Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMARCB1Q12824 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMARCB1Q12824 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMARCB1Q12824 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMARCB1Q12824 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SMARCB1Q12824 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMARCB1Q12824 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMARCB1Q12824 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMARCB1Q12824 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SMARCB1Q12824 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMARCB1Q12824 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMARCB1Q12824 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SMARCB1Q12824 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SMARCB1Q12824 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMARCB1Q12824 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMARCB1Q12824 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMARCB1Q12824 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMARCB1Q12824 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SMARCB1Q12824 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMARCB1Q12824 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMARCB1Q12824 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMARCB1Q12824 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SMARCB1Q12824 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SMARCB1Q12824 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMARCB1Q12824 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMARCB1Q12824 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMARCB1Q12824 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SMARCB1Q12824 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMARCB1Q12824 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SMARCB1Q12824 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMARCB1Q12824 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMARCB1Q12824 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMARCB1Q12824 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMARCB1Q12824 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMARCB1Q12824 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMARCB1Q12824 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMARCB1Q12824 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMARCB1Q12824 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMARCB1Q12824 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMARCB1Q12824 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SMARCB1Q12824 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMARCB1Q12824 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMARCB1Q12824 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMARCB1Q12824 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMARCB1Q12824 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMARCB1Q12824 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMARCB1Q12824 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMARCB1Q12824 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMARCB1Q12824 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMARCB1Q12824 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMARCB1Q12824 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMARCB1Q12824 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMARCB1Q12824 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMARCB1Q12824 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMARCB1Q12824 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMARCB1Q12824 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMARCB1Q12824 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMARCB1Q12824 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMARCB1Q12824 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SMARCB1Q12824 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMARCB1Q12824 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMARCB1Q12824 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMARCB1Q12824 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMARCB1Q12824 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMARCB1Q12824 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMARCB1Q12824 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMARCB1Q12824 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMARCB1Q12824 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMARCB1Q12824 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMARCB1Q12824 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMARCB1Q12824 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMARCB1Q12824 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMARCB1Q12824 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMARCB1Q12824 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMARCB1Q12824 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMARCB1Q12824 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMARCB1Q12824 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMARCB1Q12824 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SMARCB1Q12824 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SMARCB1Q12824 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMARCB1Q12824 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMARCB1Q12824 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMARCB1Q12824 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SMARCB1Q12824 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SMARCB1Q12824 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMARCB1Q12824 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMARCB1Q12824 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMARCB1Q12824 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SMARCB1Q12824 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMARCB1Q12824 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMARCB1Q12824 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMARCB1Q12824 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMARCB1Q12824 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMARCB1Q12824 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMARCB1Q12824 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMARCB1Q12824 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMARCB1Q12824 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMARCB1Q12824 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMARCB1Q12824 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMARCB1Q12824 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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