Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms