Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms