Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms