Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC14□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC14□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC14□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC14□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC14□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.1 ms