Protein–RNA interactions for Protein: Q01860

POU5F1, POU domain, class 5, transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU5F1Q01860 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms